名言簿丨mottobook
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一些常用的科研网站

1.文献搜索与下载

可能只有在离开学校后,你才能体会到“自由查阅下载文献”是多么奢侈的一件事!这时候,能提供一些帮助的可能只有SCI-hub!以下是一些SCI-hub的镜像网站,欢迎试用。

镜像链接:
https://sci-hub.se/
https://sci-hub.st/
https://sci-hub.ru/
https://www.sci-hub.mk/
https://www.sci-hub.ee/
https://www.sci-hub.wf/

虽然SCI-hub收集了8千多万份文献,但最近几年的文献还是很难下载到。我自己遇到无法下载文献的时候,经常在基迪奥生信交流7群(QQ群号:903695710)发起文献求助,大家都是比较热情的,大家也可以加群一起交流学习!

2.科研数据分析与作图

关于科研数据分析与作图的网站,必须推荐我最熟悉OmicShare! OmicShare其实已上线8年了,我个人也持续参与了很多的开发和优化工作,并且撰写了很多案例教程。

工具链接:
https://www.omicshare.com/tools/

OmicShare是由基迪奥生物开发的,一个专注为广大科研人员提供生物信息分析工具、组学分享社区以及生物信息视频教程的线上平台。当前,OmicShare共有161个小工具,功能非常强大,出图效果非常美,我自己特别喜欢那些动态交互小工具,通过参数调整可得到心中最期待的图表样式!

3.分析流程与个性分析

Omicsmart是基迪奥开发的一站式多功能数据分析平台,包含单细胞/空间/常规转录组分析、蛋白/代谢组分析、微生物多样性分析等13个基础分析平台,以及WGCNA关联分析、ceRNA关联分析、转录代谢关联分析等11个个性分析平台。

工具链接:
https://www.omicsmart.com/home.html#/

此外,Omicsmart也是基迪奥的动态交互项目分析报告系统。如果由基迪奥生物提供测序分析服务,在我的项目栏目中可以直接查看项目结果,在此基础上大家也可以通过更改参数,重新进行更加个性化的流程分析和图表样式调整等。

4.研究背景与综述的撰写

如何从海量文献中找到与研究课题相关的文献是一个技术活,也非常考验耐心,很多情况下,我们花费时间和精力下载下来的文章与自己的研究主题相关性不大。这里推荐一个叫Connected Papers的在线工具,只需输入一篇典型文章,它会以相关性网络图的形式给出相关研究领域其他类似的文章。

这样,我们就可以快速找到与研究主题相关的参考文献,创建参考文献目录,并且对感兴趣的研究领域有一个直观的了解。

链接:
https://www.connectedpapers.com/

5.实验方法的查询与撰写

关于做实验,如有前辈摸索好的实验方法、条件,我们就不需一切从零开始,而且实验的成功率也会非常高。这里推介一个可免费获取详细实验方案的平台:Bio-protocol,拿到实验方法后,写文章的时候就省事很多。

网站链接:
https://bio-protocol.org/en

类似的平台还有STAR Protocols、Nature Protocols等,分别由Cell、Nature等出版集团创建和维护。

网站链接:
https://star-protocols.cell.com/search
https://www.nature.com/nprot/

6.论文中英文翻译与查重

中英文互译一直是令人头疼的事情,看文献到还好文,关键是写文章的时候要翻译成英文。前者倒还好,毕竟我们知道翻译结果是否符合中文习惯,而后者就难了。关于将中文翻译成英文,我强烈推荐ChatGPT!

ChatGPT具有非常强的上下文理解能力,翻译能力自然不会差。有大佬收集了非常多ChatGPT的镜像站点,大家可以试一试!

站点链接:
https://github.com/xx025/carrot

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